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A esterilização por ozônio pertence à reação de oxidação bioquímica, que decompõe as enzimas necessárias para a oxidação interna da glicose nas bactérias; Também pode interagir diretamente com bactérias e vírus, danificando suas paredes celulares e RNA, quebrando polímeros macromoleculares como DNA, RNA, proteínas, lipídios e polissacarídeos e interrompendo o metabolismo material, o crescimento e os processos de reprodução das bactérias; Também pode penetrar no tecido da membrana celular, invadir a membrana celular e atuar nas lipoproteínas da membrana externa e nos lipopolissacarídeos internos, causando distorção da permeabilidade das células, levando à lise e morte celular. Também dissolve e desnatura os genes genéticos, cepas parasitárias, partículas de vírus parasitas, bacteriófagos, micossomas e pirogênios (metabólitos de vírus bacterianos, endotoxinas) nas bactérias mortas.
Os princípios da tecnologia asséptica em microrganismos podem ser divididos em três tipos: antibacteriano, bactericida e bacteriolítico. O uso do ozônio como agente de esterilização pertence ao bacteriolítico.
